Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSF1P09603 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSF1P09603 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSF1P09603 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSF1P09603 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSF1P09603 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSF1P09603 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSF1P09603 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF1P09603 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms