Protein–RNA interactions for Protein: P08172

CHRM2, Muscarinic acetylcholine receptor M2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM2P08172 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRM2P08172 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms