Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms