Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERPIND1P05546 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SERPIND1P05546 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms