Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM1O95202 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM1O95202 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM1O95202 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms