Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms