Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSO75390 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSO75390 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSO75390 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms