Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms