Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms