Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSVO60911 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSVO60911 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSVO60911 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSVO60911 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSVO60911 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSVO60911 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSVO60911 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTSVO60911 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSVO60911 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms