Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMDSO60547 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms