Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms