Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMC8O43402 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMC8O43402 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMC8O43402 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EMC8O43402 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EMC8O43402 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EMC8O43402 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMC8O43402 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms