Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms