Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNJ2O15056 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNJ2O15056 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms