Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF10O15013 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms