Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms