Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APAF1O14727 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms