Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCSO14618 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCSO14618 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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