Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms