Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EBAG9O00559 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms