Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms