Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms