Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms