Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms