Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTOA8MTQ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms