Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDR42E2A6NKP2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms