Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMX2A2RU54 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms