Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms