Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC61Q9Y6R9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms