Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSAG2Q9Y5P2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms