Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms