Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED5Q9Y3A6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms