Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KCNIP3Q9Y2W7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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