Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms