Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms