Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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