Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms