Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms