Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms