Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEFF2Q9UIK5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms