Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms