Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms