Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNAL1Q9UBT7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms