Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms