Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD5Q9P267 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD5Q9P267 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms