Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms