Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERVK13-1Q9NX77 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms