Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms