Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms